Selon le droit suisse, le Protocole militaire est en principe l’unique organe de liaison officiel entre les Attachés de Défense étrangers accrédités en Suisse et les autorités suisses. Les Attachés de Défense étrangers doivent s’adresser systématiquement au Protocole militaire.

Le protocole militaire organise et encadre les visites officielles de la Cheffe du DDPS et du Chef de l'Armée selon les coutumes diplomatiques internationales. Parallèlement, il fournit un appui lors des visites et manifestations organisées par des représentants du DDPS et de l’armée.

De hauts invités au niveau du Président de la Confédération, de la Cheffe du DDPS et du Chef de l'Armée sont reçus en visite officielle avec les honneurs militaires. Le protocole militaire appuie l’Armée suisse dans le domaine du cérémonial militaire.

Le Protocole militaire est l'autorité en charge pour l'octroi de l'autorisation pour le porter des uniformes, l'entrer avec véhicules automobiles militaires, le transport des armes et des munitions provenant de forces armées étrangères en Suisse. L'entrée en Suisse n'est autorisée qu'avec une autorisation valable du Protocole militaire.

Le Protocole militaire coordonne avec les Représentations suisses et les autorités compétentes du pays de destination les autorisations de porter des uniformes, des véhicules automobiles militaires, des armes et des munitions des membres du personnel de l'Armée suisse à l'étranger.